Το αγώνισμα του Μαραθωνίου των ανδρών των Θερινών Ολυμπιακών Αγώνων του 2004 έλαβε χώρα στις 29 Αυγούστου του 2004 στους δρόμους της Αθήνας.
Την δεύτερη και τρίτη θέση κατέλαβαν οι Mebrahton Keflezighi και Vanderlei de Lima από τις Η.Π.Α και τη Βραζιλία αντίστοιχα.